硼砂外用清热解毒，消肿，防腐;内服清肺化痰。硼砂用于急性扁桃体炎，咽喉炎，咽喉肿痛，口舌生疮，口腔炎，齿龈炎，中耳炎，目赤肿痛，汗斑，为五官科疾患的常用药!内服用于痰热咳嗽。
硼砂在人医学上,硼砂用于皮肤黏膜的消毒防腐、氟骨症、足癣、牙髓炎、霉菌性阴道炎、宫颈糜烂、褥疮、痤疮、外耳道湿疹、疱疹病毒性皮肤病、癫痫的治疗，近年来还用于肿瘤的治疗。
硼砂在动物医学上,硼砂用于鸡喉气管炎、山羊传染性脓疱病、猪支原体肺炎、牛慢性黏液性子宫内膜炎的治疗，作为饲料添加剂也备受人们的关注。
1、硼砂治气闭痰结火结，喉胀不通： 蓬砂一钱。放口中噙化。(《方脉正宗》)
2、硼砂治膝部扭伤： 西月石(法制)粉末少许，于晚上临睡前，放于目内眺角上，左侧扭伤点右眼角，右侧扭伤点左眼角。一般一至三次见效。放药后可能会流泪。〔《浙江中医杂志》9(l)：24，1966〕
3、硼砂治咽喉肿痛： 蓬砂、白梅等分。捣丸芡子大。每噙化一九。 (《经验方》赃棺丹)
4、硼砂治诺蛇咬病肿：硼砂一两。研细为末，以园内生篓葱，就上取却葱角尖，倾入硼砂末，却以角尖覆一七日，握出葱，倾硼砂汁干一张紧薄纸上，阴干。每在伤处，取钱孔大纸贴之。 (《普济方》硼砂散)
5、硼砂治咽喉肿痛及走马喉痹： 蓬砂、马牙硝各一分，丹砂半分，斑鳖二枚(去头、翅、足，炒)。上四味，共研为末，以生姜自然汁煮面糊，和丸如梧桐子大，腊茶为衣。每服二丸，腊茶下。 (《圣济总录》蓬抄丸)
6、硼砂治慢性气管炎： 硼砂、南星、白芥干各等量，共研细末。每曰二次，每服六分。(内蒙古《中草药新医疗法资料选编》)
7、硼砂治缠喉风，风热喉痹： 硼砂(生研)、 自矾(生研)各一钱，西中黄、人爪甲(焙脆，研)各一分。为极细末，以烂白霜梅肉三钱，研糊分作四丸，嗡化，取涌顽痰。(《张氏医通》硼砂丹)
8、硼砂解毒食，并治恶疮疗毒： 蓬砂四两，研细，真菜油一斤，瓶内浸之。遇有毒看，服油一小盏。(《本草汇言》)
9、硼砂治咽喉口齿新久肿痛及久嗽痰火咽哑作痛： 玄明粉、硼砂各五钱，朱砂六分，冰片五分。共研极细末，吹搽患上，甚者日搽五、六次。(《外科正宗》冰硼散)
10、硼砂治噎食： 养麦秸烧灰淋汁，人锅内，煎取自霜一钱，入蓬砂一钱，研末，每酒服半钱。 (《海上方》)
11、硼砂治舌肿胀：好硼砂为细末，用薄批生姜蘸药搐舌肿处，少时即退。 (《普济方》)
12、硼砂治鹅口疮： 硼砂二钱，雄黄三钱，甘草一钱，冰片二分五厘。上为细末，蜜水调涂或干掺。 (《疡医大全》四宝丹)
13、硼砂治口臭、口干、口舌疮： 硼砂二两，片脑、康香各一钱，马牙硝(风化)四两，寒水石(煅)十两。上为细末，用甘草膏和丸，如麻子大，不拘时含-丸咽津。 (建奇效良方》硼砂丸)