预防腹膜炎的根本措施是对可能引起腹膜炎的腹腔内炎症性疾病，及早进行适当的治疗。任何腹腔手术甚至包括腹腔穿刺等皆应严格执行无菌操作，肠道手术前应给予抗菌药物口服可减少腹膜炎的发生。