小儿IgA肾病的病因还不十分清楚，与多种因素有关，多数学者认为本症是含有IgA的循环免疫复合物在肾内沉积而致病，复合物中的抗原可能与呼吸道或胃肠道黏膜处感染的病毒，细菌，或食物中的某些成分有关。