生殖器疱疹一般不会影响寿命，但是反复发作会影响身体健康。HSV-2是生殖器疱疹的主要病原体（90％），传染后引起初发生殖器疱疹。初发生殖器疱疹消退后，残存的病毒经周围神经沿神经轴转移至骶神经节而长期潜伏下来，当机体抵抗力降低或某些激发因素如发热、受凉、感染、月经、胃肠功能紊乱、创伤等作用下，可使潜伏的病毒激活，导致复发。男性生殖器疱疹和女性生殖器疱疹是一样的，不过女性患有生殖器疱疹会容易导致不孕或是传染给胎儿。避免非婚性行为，杜绝多性伴，是预防生殖器疱疹的根本措施。