现代医学认为跖疣的发病机理是人类乳头瘤病毒(HPV)所引起的。通过直接接触传染所致(亦有自身接触)，外伤和细胞免疫功能低下或缺陷也是重要原因。人类乳头瘤病毒可以通过皮肤的细小破损而直接接种并传染，因此皮损越来越多，再加上足部每天受力和鞋的摩擦，从而加重病情，使治疗起来难度加大。

　　中医认为本病多因气血失和，腠理不密，复感外邪，凝聚肌肤，或因怒动肝火，肝旺血燥，筋脉不荣，以致气血凝滞，加之足底部受压及摩擦，而发生皮疹。