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孩子病毒感染出现体温39℃，持续超过5天，这时候一定要明确病毒种类，因为不同的病毒可能用药会有很大的区别性。还要明确引起病毒感染的部位以及造成的疾病状态，还可能与孩子自身的免疫状态也有关系。具体处理方法如下：1、病毒种类：孩子的病毒分为很多种类，比较常见的病毒有鼻病毒、呼吸道病毒、流感病毒、EB病毒。所使用的药物完全不同。这时候不能单纯说明病毒感染，还要明确是哪一类病毒感染，对症使用的药物会完全不同；2、感染程度：在新型冠状病毒感染的时候，虽然都是新型冠状病毒造成的感染，但每一个人的感染程度不同，对症治疗的药物也会差异很大；3、孩子的自身免疫状态：如果孩子自身免疫状态极差，这时候可以适当用免疫球蛋白，增加孩子的抵抗力，对于孩子的发热39℃也会有一定帮助。所以孩子病毒感染如果持续存在，一定要找到孩子的明确病因，然后积极地进行对症治疗。