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胆结石通常较难通过自然管道排出，但极少数情况下，由于胆结石直径较小，可能只有几毫米，可以通过胆囊收缩或胆管排放，进入胆管下段，通过胆管下段进入十二指肠，随十二指肠进入小肠，再进入大肠，随粪便排出体外。大部分结石无法通过以上途径排出，如胆囊结石和胆管结石，尤其是肝内胆管结石。两种结石成分不同，胆囊结石通常以胆固醇结石为主，而胆管结石通常以胆色素结石为主。上述种类结石较好的治疗方法是通过手术治疗，胆囊结石通过腹腔镜切除胆囊，即可将结石完全取净。胆管结石需要进行胆管探查，打开胆管后，在胆道镜下取净肝内结石。即便没有取净，留置T管后，也可以通过术后取石，使结石尽可能取净，因此，手术是尽可能使胆结石取净的最佳治疗方法。