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女性肾囊肿的发生原因目前未十分明确，但是女性肾囊肿和男性肾囊肿发生机理基本一致，并未发现肾囊肿在女性当中的发生率较高。肾囊肿分为单纯肾囊肿和多囊肾，具体病因如下：1、单纯肾囊肿：单纯肾囊肿的发生机理并非十分明确，主要由于远曲小管或近曲小管的膨胀，或者囊性病变引起。通常治疗单纯肾囊肿以手术治疗为主，没有任何药物或者其他治疗方法可以进行干预；2、多囊肾：属于常染色体疾病，包括显性遗传和隐性遗传。如果为显性遗传的肾囊肿，发病较晚，通常在30岁以后发病，而且如果管理得当的患者，基本上对生存期没有任何的障碍；如果为隐性遗传的多囊肾，通常起病较早，患者生存的年限较短，患者可能在后期需要进行透析治疗，因为患者的肾脏会变逐渐生成很多囊肿，最终失去功能。