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脑垂体变薄的主要危害是垂体内分泌功能受到抑制，分泌激素水平下降，主要包括以下几种：1、血清皮质醇下降：患者会出现精神萎靡、浑身酸疼等表现；2、促肾上腺皮质激素下降：患者会出现甲状腺功能减退以及甲状腺激素水平下降。有时垂体虽然较薄，但是患者进行垂体相关激素的检查时可以发现激素水平正常，并不一定会出现严重功能障碍，也并不一定会危及所影响的下游内分泌器官，具体情况则需要结合神经影像学和垂体内分泌激素检查两方面因素进行综合判断。脑垂体变薄是常见的神经影像学描述，特别是进行垂体及鞍区磁共振检查时，可以见到垂体较扁，位于鞍底位置，常见于空蝶鞍综合征、垂体瘤、颅咽管瘤等鞍区病变。垂体有很多内分泌功能，每种激素下降都会引起相应靶器官激素水平下降，也可能引起全身各部位神经功能障碍或者是其他靶器官功能障碍。