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胃镜检查和肠镜检查主要的区别如下：1、胃镜检查：经口进镜，主要检查食管、胃黏膜以及十二指肠球黏膜的病变，对于发现食管癌、胃癌、十二指肠球部溃疡、胃溃疡等疾病属于较为有效的检查方法。胃镜检查时需要受检者禁食4-6小时，术前不需要服用药物；2、肠镜检查：经肛门进镜，可以观察直肠、降结肠、横结肠、升结肠等结肠病变，有时还可以通过回盲瓣观察到回肠末端有无病变，可以较好地发现炎症、肿瘤等疾病。在做结肠镜检查前，为保证能够清楚观察黏膜面，受检者需要服用清肠药物，如聚乙二醇、甘露醇等。并且在做结肠镜前，受检者不可摄入带皮、带籽的食物，否则这类食物会聚积在肠道内，掩盖黏膜，从而导致漏诊的发生。因此，肠镜检查的饮食要求比胃镜检查更为严格。