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目前太田痣的病因不是非常明确，可能与遗传相关，属于染色体的显性遗传，胚胎发育的过程中，正常黑素细胞可以由神经嵴向表面表皮移行，最终停留在表皮细胞的基底层，由于各种原因，停在真皮层，分泌黑色颗粒，导致颜色的改变。如果患儿有太田痣，他的家人可能会有真皮色素性病变，但也存在患儿家人无病变的情况。因此太田痣目前无非常明确的原因。