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科学的观点，通过多年的大样本统计，试管婴儿的孩子畸形率无显著增加，但不能说试管婴儿无问题。做试管婴儿的患者，多数是由于有生育障碍，尤其男方患有严重少弱畸精子症和无精症，女方卵巢储备功能下降，家族有遗传疾病，本身基因存在问题。通过试管婴儿怀孕，流产率和胎儿畸形的发病率，比正常人稍高，但试管本身并没有增加胎儿畸形的发病率。