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常见的卵巢肿瘤标志物包括CA12-5、甲胎蛋白、CA19-9及鳞状上皮内抗原等。肿瘤标志物可于一定程度上辅助判断卵巢肿瘤的良恶性，但肿瘤标志物升高并不代表卵巢肿瘤一定属于恶性。 其中CA12-5升高既可以由于卵巢癌导致，也可以由于卵巢良性肿瘤、卵巢巧克力囊肿、子宫内膜异位症、子宫腺肌症、盆腔炎引起。此外，妊娠女性也常出现CA12-5在短期内升高。