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颅内囊肿通常由先天性因素导致，属于胚胎发育过程中组织残留所形成，通常分为以下几类：1、包裹脑脊液的囊肿：比如蛛网膜囊肿，常见的发生部位是颞极或者枕大池，主要由于蛛网膜包裹脑脊液形成；2、具有分泌功能的囊肿：如表皮上的囊肿，常常发生在桥小脑角区，这些囊肿是由于囊壁具有内分泌功能，向囊内分泌角化蛋白、脂质等物质，导致囊肿逐渐扩大，进而引起症状；3、Rathke囊肿：Rathke囊肿是一种先天性细胞残留所形成的囊肿，位于垂体部位，在囊肿增大时可引起垂体相关的内分泌症状；4、松果体区的囊肿：此部位的囊肿多由先天因素导致，通常在后天的观察过程中不会出现明显的增大，也不容易引起症状。