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脑干肿瘤根据肿瘤性质决定能否进行手术治疗。约半数脑干肿瘤可进行手术治疗，包括海绵状血管瘤、血网、转移瘤等；胶质瘤边界明显时，即肿瘤细胞和神经细胞区分明显时，可尝试手术治疗；若边界不明显，无法分辨肿瘤细胞和正常的神经细胞，此时，不主张针对肿瘤进行手术治疗，可进行姑息性手术，如分流手术、减压手术、部分切除术、活检手术等。