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软组织肉瘤分子靶向治疗属于基因治疗，与传统化疗机理完全不同，具有高度的选择性，称为精准治疗。主要药物包括酪氨酸激酶抑制剂，如索拉非尼、帕唑帕尼、舒尼替尼、阿帕替尼、西地尼布以及贝伐单抗等，通过抑制肿瘤血管生成来控制肿瘤的发展。但分子靶向治疗目前还存在较多问题，疗效尚不确定且价格昂贵，尚未成为软组织肉瘤的常规治疗手段。