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小便刺痛主要是由病原菌感染尿道引起，男性、女性都可发生，病原菌包括细菌、支原体、衣原体，部分性病也会出现小便刺痛，小便刺痛时要多饮水，及时到专科医院检查，涉及的科室有皮肤性病科、泌尿外科、抗感染科，尿道有分泌物时可进行分泌物培养、涂片检查，明确病原体的类别，结合病原体用药治疗，常见的病原体有大肠杆菌、金色葡萄球菌、支原体、衣原体、淋球菌。