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小儿胃镜检查方法与成人胃镜检查没有较大区别。因儿童器官如食道和胃相对成人较小，所以做小儿胃镜应选择超细胃镜，如此检查者的不适感会大大减小，有利于医生操作和提高检查者舒适度。小儿胃镜操作方法与成人内镜的操作方法相同，即通过口腔进入食道和胃部。通常胃镜检查并不是只观察胃部，也可观察到食道、十二指肠球部、降部的病变。