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一般核磁共振全身病变或不适部位均可进行检查。其最大优势为对神经系统以及软组织有较高的分辨率，优于CT检查。其缺点为检查时间较长，部分患者无法耐受，核磁共振检查需10-40分钟不等，在检查过程中身体可能发热，或产生其他不适感。磁共振检查具有禁忌症，如有磁性植入物的患者，或体温高到38℃以上的患者等，禁止行核磁共振检查。