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多数肠胃炎引起的发烧可伴有腹泻症状。治疗时，应首先化验大便，检查大便内有无白细胞等，此时应警惕是否合并痢疾。北方地区常见饮食不当，应警惕细菌性痢疾，其发病急且重，需高度警惕。其次，应化验血常规。由于部分肠胃炎引起的发烧症状较重，因此应根据化验结果选择抗生素，包括普通沙星类抗生素或头孢类抗生素。一般引起的发烧以消炎为主。