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普通结肠镜检查患者有不舒服的感觉，如有轻微的腹胀、腹痛。无痛结肠镜检查与无痛胃镜相同，给予患者速效麻醉剂，使其快速进入镇静睡眠阶段，在不知不觉中做完结肠镜的检查，患者无任何不舒服的感觉。结肠镜检查主要用于不明原因的腹痛、腹泻、下消化道出血，如大便带血、黑便等。对于炎症性肠病，息肉治疗后，结肠癌治疗后，均需定期检查结肠镜。