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目前为止，多囊卵巢综合征的病因并不十分清楚，有可能是代谢的原因，也有可能是遗传的因素，也可能是环境的因素共同作用所致。在门诊中经常会发现多囊卵巢综合征患者的姐妹也可能患有这个疾病。但是又有一些情况，例如单卵双胎里面，其中一个的女孩子患有多囊卵巢综合征，但是她的单卵双胎的姐妹可能没有这个病，所以说多囊卵巢综合征有可能不是单一因素引起的，可能是由于多种因素的共同作用。另外，有一些常染色体上多基因的基因突变，可能也参与了多囊卵巢综合征的发病过程。所以，通过前辈、专家的临床研究，到目前为止，没有找到一个单一的发病的原因可以解释多囊卵巢综合征所有的问题。