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在药物治疗无效的情况下，可能要选择进一步的外科手术治疗。有些患者可能因肠道功能减退或直肠、肛门结构改变导致排便困难，这类患者选择用外科治疗的手段，已经取得一定的效果。长期便秘的患者往往可能有非常明显的心理障碍，所以治疗中确实存在一些麻烦和困难，所以每个便秘患者就诊后，医生都会仔细地询问患者的病史，患者的便秘状态，然后根据患者的情况，去做相应的检查。在专科医院有很好的检查的手段和方法，比如结肠慢传输型便秘患者可以做结肠运输试验，以了解结肠的功能状态，还可以给患者做排粪造影。排粪造影就是通过患者的排便动作了解盆底、直肠、肛门的结构是否发生变异或者异常。在检查中，可能经常会看到一些异常的排便结构，这样的情况通过外科手术可以进行必要的干预。结肠慢传输型的便秘，可以通过减少结肠的长度，走捷径的路线进行治疗。走捷径的路线指大便不通过残废的肠道，而且这些方法确实已取得部分效果，而且对于一些慢传输型便秘有一定的疗效。出口梗阻型便秘患者通过外科的手术治疗可以调整一些解剖结构，比如直肠黏膜脱垂、直肠脱垂、直肠前凸改变均可以通过手术的方式来进行干预。盆底下降的患者可以通过悬吊盆底的方法进行治疗，已取得一些效果。有些患者通过手术方法治疗，排便可得到改善，部分患者的排便状态比手术前有所改变。外科治疗不是唯一的目的，真正的便秘治疗要联合内科、心理科、外科一起完成。所以便秘已经变成非常普遍、棘手的外科难题。