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急性上呼吸道感染的病因目前不是完全明确，但是70%-80%是由病毒感染引起的。常见的病毒类型主要包括流感病毒、副流感病毒、呼吸道合胞病毒、腺病毒、鼻病毒、柯萨奇病毒、麻疹病毒、风疹病毒等。细菌感染可直接或者继发于病毒感染后发生，同时以溶血性的链球菌细菌最多见，其次会出现流感嗜血杆菌、肺炎链球菌、葡萄球菌等，偶尔也可以出现革兰氏阴性杆菌感染。感染主要表现为鼻炎、咽喉炎或扁桃体炎。另外急性上呼吸道感染也和患者的免疫、年龄、气候等因素密切相关，比如寒冷空气可以刺激腺体增加粘液分泌，导致呼吸道的纤毛运动减弱，黏膜血管收缩，局部血液循环障碍容易引起继发的一些感染问题。同时由于吸入了有害气体或者颗粒，也可以引起来上呼吸道感染，比如香烟、烟雾、粉尘，刺激性气体二氧化碳、二氧化氮、有氯气等，这些因素属于理化因素，也可以损伤气道上皮，导致气道的净化功能下降引起急性上呼吸道感染等。