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扁桃体炎的主要致病菌为乙型溶血性链球菌，非溶血性链球菌、葡萄球菌、肺炎链球菌、流感杆菌以及腺病毒等也可以引起本病。扁桃体炎在临床上选用抗生素治疗，青霉素为首选。像一代、二代的头孢是次之选用的，头孢克肟胶囊属于第三代头孢，主要对革兰氏阴性菌比较敏感。应用青霉素治疗2-3天没有效果，需要分析原因，必要时候可以做细菌培养。如果感染为革兰氏阴性菌，或者细菌培养出来以后，对头孢克肟比较敏感，可以选用头孢克肟来治疗。首选的时候，一般不选用头孢克肟来治疗扁桃体炎。