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随着质子泵抑制剂类药物、PPI，以及内科治疗手段的不断优化，单纯胃溃疡患者很少再需要进行手术治疗。当长期慢性溃疡形成瘢痕性幽门梗阻，内科治疗手段无效时，才会考虑手术治疗。 长期溃疡导致慢性瘢痕形成穿孔，需要通过手术修补。长期慢性溃疡局部恶变者，甚至需要进行胃切除，即胃癌根治手术。另外，溃疡形成大出血，消化内镜不能彻底止血的情况下，也需要进行手术治疗。但是手术困难程度不一样，手术具体时间各异，进行穿孔修补术相对简单，若合并恶变等其它情况，还需要做根治性手术，手术时间在2-3小时。