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宝宝出现肠胃功能紊乱，是否能够自愈要视情况而定，具体情况具体分析，具体有以下几种情况：1、病毒感染：宝宝出现胃肠功能紊乱，表现为食欲下降、呕吐、腹痛、腹泻等，有可能是由于病毒感染导致，即胃肠型的病毒，病毒感染一般都是自限性的过程，大概经过3-5天，一般不超过一周都能够自愈，所以对于病毒感染所引起来的胃肠功能紊乱，能够自愈；2、细菌感染：宝宝出现胃肠功能紊乱是由于急性肠胃炎，特别是细菌感染导致胃肠功能紊乱，出现腹痛、腹泻等情况。如果是细菌感染，一定要及时加用敏感抗菌素进行抗感染治疗，否则胃肠功能紊乱无法自愈；3、喂养不当：宝宝是由于喂养不当、消化不良所引起来的胃肠功能紊乱，这种情况也比较难自愈，一定要及时调整饮食，必要时添加肠道益生菌，调整肠道菌群，从而使胃肠功能紊乱逐渐得到缓解。