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胸腺瘤导致重症肌无力至今起因尚未明确。重症肌无力是一种影响神经、肌肉接头传递的自身免疫性疾病，其确切发病机理目前还不明确。但是有关该病的研究还是有很多的，其中研究最多是重症肌无力与胸腺的关系以及乙酰胆碱受体抗体在重症肌无力中的作用。大量研究发现重症肌无力患者神经肌肉接头处，突触后膜上的乙酰胆碱受体数目要减少，受体部位存在抗乙酰胆碱，且突触后膜上由IgG和C3复合物的沉积，并且证明血清中抗乙酰胆碱抗体的增高和突触后膜上沉积所引起的有效乙酰胆碱受体数目减少是本病发生的主要原因，而胸腺是乙酰胆碱抗体产生的主要场所，因此本病的发生一般与胸腺有密切的关系。