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奥硝唑和甲硝唑属于同一类的抗菌药物，属于硝基咪唑类的抗菌药物。首先抗菌机制相同，主要是通过在无氧的环境下，干扰病原菌的代谢的过程起到抗菌作用，奥硝唑和甲硝唑相比较，甲硝唑属于第一代的硝基咪唑类抗菌药物，而奥硝唑是在甲硝唑的基础上进行相应的优化，属于第三代硝基咪唑类的抗菌药物。在抗菌效果方面奥硝唑的抗菌效果通常优于甲硝唑，在用药安全性方面奥硝唑不良反应也是少于甲硝唑。甲硝唑容易导致患者出现胃肠道的反应，奥硝唑的胃肠道副作用要少于甲硝唑，甲硝唑有可能和酒精发生双硫仑反应，而奥硝唑的结构特点和酒精没有双硫仑反应。总之奥硝唑片和甲硝唑片都是属于硝基咪唑类的抗菌药物，但是在抗菌药物的效果以及用药安全性方面，奥硝唑优于甲硝唑。