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肝囊肿形成的原因，现在并不是特别清楚，有以下几种原因：1、先天因素：大多数人认为，肝囊肿的形成可能是肝脏在发育过程中，胚胎发育出现了畸形或者异常，从而导致形成了一种薄膜性结构。而这种膜可以分泌大量黏液，随着黏液逐步积聚，就形成了一个囊肿；2、外界因素：当然也有其他一些少见的因素，比如曾经出现外伤、寄生虫感染等，这个地方出现坏死以后，形成了积液，这也是一种囊肿形成的比较少见的形式；3、其他疾病因素：另外一种情况，多囊肝，是一个遗传性疾病，也就是肝脏里面会有大量囊肿形成，这种疾病需要早期发现和治疗。否则随着囊肿不断增加以后，可能会使肝功能逐步变差，甚至完全丧失，到终末期，这样的病人有可能需要接受肝移植。而这种有多囊肝、多囊肾的病人，因为有遗传的倾向，因此这样的病人发现以后，也会建议病人，让子女去做相关的检查，及早发现，及早干预，尽可能避免发现太晚以后，由于囊肿过多、过大，使整个肝脏实质细胞变得非常少，不足以满足机体的需要，从而可能会危及生命健康。