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肾囊肿手术一般需要住院3-7天，也有人是不一样的，但是大部分是3-7天。如果单侧的肾囊肿超过3个，大小超过5cm，向内生长，这种情况就容易挤压肾脏的组织，而导致肾脏的功能改变，甚至会导致肾脏形态的改变，所以这个时候就需要给病人做肾囊肿的手术。手术分别如下：1、穿刺：肾囊肿手术通常包括穿刺，穿刺完了以后抽囊液，然后再打固化剂，这样囊肿就没有。如果是简单的抽囊液，然后打固化剂，一般住院只需要大概2-3天就可以出院；2、去顶减压术：去顶减压术一般大概要5-7天；3、囊肿切除术：囊肿切除术一般见于复杂的囊肿或者怀疑可能有不好的东西，或者怀疑有恶性的东西，这个时候会选择做囊肿的切除。如果是肾囊肿的切除，一般是大概5-7天。所以囊肿的手术一般是需要3-7天的，但是也根据每个人的病情不一样，有的人可能时间短一点，有的人可能时间会更长一点。