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肚脐上方疼痛的原因具体如下：1、与脐炎等炎症性疾病相关，肚脐上方存在脐部本身结构，由于肚脐为开口较小的解剖结构，患者较胖或肚脐本身开口较小，易在深部积存水、灰尘和细菌等。此外，由于肚脐深部温度、湿度较高，清洁度不佳易形成肚脐发炎。多数患者随口服抗生素或局部脓肿切开，炎症控制后疼痛可自然缓解；2、肚脐上方尤其是深部疼痛，可能来自于肠管相关疾病。肚脐上方肠管主要以小肠为主，出现肠扭转、套叠等，可导致疼痛；3、病变来自于更深层系膜或腹膜后组织，如双侧输尿管或出现网膜炎、系膜炎等。若患者出现不明原因的疼痛，可通过超声、CT等影像学检查，排查腹腔内脏器是否出现相关病变。