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儿童矮小症的病因，可分为以下几大类：一、生理性原因：包括家族性矮小和体质性青春期延迟，其生长速度基本正常，骨龄与身高、年龄相符。二、病理性原因：1、内分泌性因素：如生长激素缺乏症、甲状腺功能减退症最为常见。2、全身性疾病：包括慢性消耗性疾病，如慢性肾病、先心病等，长期营养不良或吸收障碍。3、骨骼遗传性疾病：如软骨发育不全。4、染色体异常：如特纳综合征。三、社会心理因素：严重情感剥夺也可导致心理社会性矮小。