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目前的研究，先天性心脏病的病因确实不明确，可以归为以下三大类：1、遗传因素：遗传因素是在临床上发现很多先心病有家族史，祖父、父母有，再传到孩子。在做基因检测时能发现基因出现缺失或者变异等；2、环境因素：比如在父母怀孕时，接触不良环境，过多生磁干扰或者化学类药物的接触等，可导致患儿心脏发育异常，从而导致先心病；3、遗传和环境相互作用的因素：临床发现同卵双胎的孩子，一个有先心病，另一个没有先心病，认为先心病可能并不是一种原因造成，可能既有遗传因素的参与，也有外界环境的影响。总之，目前先心病的确切病因还不清楚。