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大部分先天性心脏病不具有遗传特性，所以不遗传。临床常见如动脉导管未闭、室间隔缺损、房间隔缺损、卵圆孔未闭以及法洛四联症，此类疾病实际上不遗传，只是在胎儿发育过程中，由于发育不全或者其他原因导致。遗传性疾病会引起心脏传导异常，或者在发育过程当中出现心脏畸形，由于其他疾病造成心脏先天性缺陷。如马凡氏综合征，由于其他遗传性疾病导致心脏损害。