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在临床中，乙肝表面抗原的高低对治疗有意义，乙肝有一个非常有效的治疗方法，即干扰素的治疗。注射干扰素的过程中，会根据乙肝表面抗原的高低，决定病人是否选择干扰素的治疗。注射干扰素的过程中，也会根据乙肝表面抗原定量的变化情况、降低情况，决定病人干扰素的治疗疗程或者治疗的时间。部分病人可能注射1年，乙肝表面抗原滴度降到很低甚至转阴，就可以停药。但也有部分病人可能1年甚至2年的时候，乙肝表面抗原仍然没有办法转阴，这时不会再延长治疗。乙肝表面抗原是乙肝感染的标记，如果发现乙肝表面抗原阳性，说明已经感染乙肝病毒，但高低与病情没有直接的关系。