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胃痛和肠痛最主要的区别是疼痛的部位不同，但大部分时候也不易分清。1、胃痛：胃痛常出现在饭前或者饭后，或者是饥饿痛，伴或不伴有恶心、呕吐、烧心、反酸。其位置多见于胸骨后或者剑突下，常见疾病有慢性胃炎、胃溃疡等；2、肠痛：肠病多呈不规律发作，如胃绞痛、针刺样疼痛或者痉挛性疼痛，可以是持续性或者不规律性。肠痛一般还伴有大便改变，伴或不伴有腹泻、腹胀、大便干或者大便干稀不定、带脓血或者黏液，多位于下腹部、脐周，常见疾病有急性肠炎、炎症性肠病、缺血性肠病、阑尾炎、肠梗阻、肠功能紊乱和肠道菌群紊乱等。因为其原因比较复杂，最好到医院做相应的检查，如大便常规、碳13或者碳14的呼气试验，以及胃镜、肠镜、腹部CT等，以便对症处理。