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胃肠道间质瘤危险度分级有极低危、低危、中危和高危之分，是指胃肠道间质瘤的复发风险分级。胃肠道间质瘤有良性和恶性之分。从生物学行为来说，如果是极低危险度，以后没有出现复发，考虑是良性。但是在极低危险度的患者中也有复发病例出现，因此肿瘤是良性还是恶性主要根据生物学行为区分。一旦有复发，肯定考虑是恶性肿瘤。 其它疾病，如纤维韧带样瘤，多认为是良性，它不会侵袭性生长，但是手术以后容易复发。因此有些极低危险度的间质瘤虽考虑是良性行为，但是也有可能发生生物学行为不好的情况，而使患者出现复发。