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小儿肠镜没有危害。有危害性的手段不能用于人的疾病诊断和治疗，这是所有医疗技术的原则。但小儿结肠镜也有一些风险，具体如下： 1、如果操作过程中不小心，会损伤黏膜，导致出血； 2、如果医生手法粗暴，可能会导致穿孔； 3、患者可能有感染风险； 4、小儿会感到腹部不适，但是由于麻醉技术的进步，无痛结肠镜的开展，目前小儿都可以在舒适状态下进行结肠镜检查，以及完成结肠镜下的治疗。 总之，结肠镜风险主要为前面三条，但是感染、出血、穿孔这些风险，在医生规范操作、小心操作下可以避免。