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患者出现牙根短的原因和治疗方法具体如下：1、内源性因素：患者在形成牙根和牙冠时，胚胎期牙胚导致牙根较短，与遗传因素有密切关联。可进行牙齿修复和根管治疗，并且进行桩冠修复，改善和解决牙根短的问题；2、外源性因素：主要是创伤、炎症导致牙根和牙槽骨吸收，造成患者牙根短。应及时进行根管治疗，如果牙根太短造成大量牙槽骨吸收，应及时拔除，彻底消除炎症，再进行镶牙的修复。