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角膜内皮细胞的数量通常无法增加，目前只能通过角膜内皮细胞移植改变数量。目前的治疗方法是在角膜内皮细胞失代偿后，进行角膜内皮移植。临床经常可以通过药物，恢复部分角膜内皮细胞的功能，如碱性成纤维细胞生长因子或自体血清等眼表修复剂，通过上皮愈合减轻角膜内皮细胞的负荷。角膜内细胞的自身修复主要靠自身的移行和扩张，即角膜内皮细胞由六边形变成五边形、四边形，边数越少，细胞则越肿胀、越圆，同时通过周边角膜内皮细胞，移行到有病变的部位。内皮细胞有重要功能，可以维持着角膜的通透性。因为角膜内皮细胞有重要的离子泵，称为钠钾离子泵，可以使角膜组织内过多的水分排出到角膜组织外。当角膜内细胞数量过少无法完成此功能时，角膜可能发生严重水肿。