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尿液里面支原体、衣原体、淋球菌是比较常见的微生物，泌尿系衣原体感染具体治疗方法如下：1、药物治疗：如果是衣原体感染，相对比较麻烦，特别是对于女性患者，可能带来比较麻烦的盆腔炎，此时需要通过口服药物来治疗，像左氧氟沙星等喹诺酮类药物，或者阿奇霉素等，进行抗真菌、抗微生物治疗，也可以进行药物敏感试验；2、一般治疗：在药物治疗的同时，注意个人卫生也非常重要，性生活前后个人的卫生，需要注意经常清洗会阴、勤换内裤。同时在饮食上可以保持清淡，避免食用重口味的食物，如辛辣食物或者酒精类的药物、酒精类的食物等可以降低盆腔炎的发生。女性如果有支原体、衣原体感染，其性伴侣也要重视，特别男性同志如果有包皮过长、包茎、包皮外翻困难或者附睾炎、前列腺炎，也需要夫妻共治，也要通过药物进行治疗，检查尿常规和前列腺液，部分患者如果有分泌物可能还要涂片。总的来说，有微生物存在，有衣原体存在，需要互相配合，药物控制。