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注射肝素针一般对孩子的智力没有影响，临床上应用肝素治疗主要是针对以下两种情况：1、针对母亲打肝素针：由于母亲在怀孕时由于患抗磷脂综合征，比较容易导致流产或者对胎儿会有影响，这时就会进行肝素治疗。在抗磷脂综合征的治疗过程中使用肝素，一般来说对胎儿的智力没有影响，这是因为肝素属于抗凝剂，对于中枢神经系统的发育没有影响；2、针对孩子打肝素针：见于孩子已经出生以后，婴儿或者是儿童如果出现栓塞性的疾病，比如下肢静脉血栓、肺栓塞，当发生这种情况时，也会给孩子应用肝素进行抗凝治疗，只要孩子没有发生脑血栓或者脑栓塞，对孩子的智力没有影响。通常其他部位的栓塞或者血栓，应用肝素治疗后，对孩子的智力也没有影响。