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痰检内容较多，主要是针对肺部感染性疾病进行病原学检查，痰液培养是最常用的痰检方法。 部分呼吸系统疾病可直接通过痰检进行疾病的确诊，如肺结核。但由于咳痰很容易混入口腔分泌物、牙龈细菌等，容易造成样本污染，导致痰检结果也不一定可靠。此外，痰检一般无法对定植菌的感染和致病菌感染进行区分，需通过纤支镜提取灌洗液进行病原学检查。