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若发现卵巢有囊肿，可以完善下列检查：1、阴道彩色超声检查：若此时想检查并做出初步诊断，建议做阴道彩色超声检查，此时主要是通过超声形态学上的检查，了解囊肿的大小、具体位置，并且了解囊肿内部是否有异常回声、周围的血流信号等。通过上述检查结果，可做出相应的临床诊断，比如大概判断囊肿的性质，如巧克力囊肿、其他病理性囊肿等；2、妇科肿瘤标志物检查：若在临床上对卵巢囊肿要做初步诊断，必要时也建议抽血检查妇科肿瘤标志物。虽然卵巢囊肿绝大部分是良性，但个别卵巢囊肿也可能发生恶性病变。因此，通过抽血检查了解CA12-5、CA19-9等指标是否出现异常升高。若患者的CA12-5出现轻度的升高，结合患者的临床病史，也可能是卵巢巧克力囊肿所导致。但若妇科肿瘤标志物出现较大幅度的异常升高，就一定要了解是否有恶性肿瘤的可能性。建议患者可以尽快考虑做手术治疗，并且在术中做冰冻病理切片，以便决定是否需要扩大手术范围。