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导致患者出现喉咙口泡泡通常有以下几种原因：1、咽喉部淋巴滤泡增生：通常病程较长，一般都有数月甚至数年的时间。并且淋巴滤泡表面比较光滑，可以看到孤立的或者成串的滤泡，一般要至医院进行鉴别；2、乳头状瘤：口咽部的乳头状瘤多半都是良性肿瘤，为乳头状瘤病毒感染引起，可以发生于儿童，也可以发生于成人。如果发现乳头状瘤，只需手术切除即可，随后再进行定期随访；3、其他疾病：如疱疹性咽峡炎和手足口病，实际都是肠病毒感染所引起，而且两者都伴有发热和疱疹，以及伴有咽腔的疼痛，所以要注意鉴别。疱疹性咽峡炎的泡泡主要存在于口咽部，而手足口病出现泡泡除在口咽部以外，还可以在手、足、下肢，舌头、颊黏膜等部位出现。并且疱疹性咽峡炎起病较急，容易引起高热，但是咳嗽、流鼻涕的症状并不严重。而手足口病有时发病比较隐匿，可能疼痛并不明显，可能也并不影响吃饭，但是常伴有流鼻涕、咳嗽。