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脑囊虫病的确诊方法主要有以下几种：1、病史：询问是否食用过被污染的肉类及蔬菜等；2、影像学检查：相对于CT而言，核磁平扫强化更为清晰；3、囊虫抗原和抗体检测：即ELISA检测，可通过化验脑脊液和血检测。正常情况下不应有滴度，滴度升高则可诊断脑囊虫病；4、化验脑脊液：做腰椎穿刺进行脑脊液化验，脑脊液内存在嗜酸性粒细胞，嗜酸性粒细胞升高可提示寄生虫感染。