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颅底凹陷症的诊断标准具体如下：1、硬腭枕大孔线：即硬腭的后缘与枕骨大孔的后缘的连线，如果枢椎的齿状突超过此线，且＞3mm，可以诊断为颅底凹陷症，是最常使用的方法；2、硬腭枕骨线：从硬腭的后缘到枕骨最低点的连线，枢椎的齿状突超过此线＞9mm，可以诊断为颅底凹陷症。颅底凹陷症是先天的畸形，主要表现为颅底骨质、颈椎的寰椎和枢椎的骨质异常，颈椎的寰椎和枢椎向颅骨内部凸起，会导致一系列的脊髓、延髓的牵拉症状。此类病人通常外观也有明显异常，表现为颈部很短和发际线很低。