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胶囊内镜检查无痛苦，但现在只适用于小肠疾病的筛查，不像胃肠镜一样可以自主观察各个部位，但是磁控胶囊内镜可弥补这些缺陷。 因为小肠镜检查比较痛苦，因此如果不想做小肠镜检查，又怀疑小肠有问题，胃镜和结肠镜检查未找到明确病变，可以进行胶囊内镜检查。如果通过胶囊内镜检查发现小肠有问题，可以再进行小肠镜检查，以避免不必要的痛苦。