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在病理中乳腺癌的免疫组化非常重要，乳腺癌的常见免疫组化指标有雌激素受体ER、孕激素受体PR、标记细胞增殖状态的抗原KI67，还有人表皮生长因子受体-2，即HER-2。另外，医院免疫组化还包括P63的表达以及CK56的表达。乳腺癌是激素依赖性肿瘤，即乳腺癌细胞的生长依赖雌激素和孕激素的刺激，雌、孕激素通过与乳腺癌细胞上的感应受体结合而发挥作用。免疫组化如果表现为雌激素受体或孕激素受体阳性，就是对内分泌治疗敏感。孕激素受体的形成，直接受雌激素受体的控制和调节，故孕激素受体阳性的乳腺癌患者，其雌激素受体大多为阳性。但有些细胞在癌变过程中，受体系统保留很少或完全丧失，不能再作为激素的靶细胞，生长不再受激素的控制与调节，表现为雌激素受体阴性的乳腺癌。